Eļļas sēklas pirms ekstrakcijas ir jātīra, lai noņemtu augu stublājus, dubļus un smiltis, akmeņus un metālus, lapas un svešķermeņus.Eļļas sēklas bez rūpīgas izvēles paātrinās piederumu nodilumu un pat var izraisīt iekārtas bojājumus.Svešķeres parasti tiek atdalītas ar vibrējošu sietu, tomēr dažās eļļas augu sēklās, piemēram, zemesriekstos, var būt kauliņi, kas pēc izmēra ir līdzīgi sēklām.Tādējādi tos nevar atdalīt ar skrīningu.Sēklas ir jāatdala no akmeņiem ar atdalītāju.Magnētiskās ierīces no eļļas augu sēklām noņem metāla piesārņotājus, un lobītājus izmanto, lai attīrītu eļļas augu sēklu čaumalas, piemēram, kokvilnas sēklas un zemesriekstus, kā arī eļļas augu sēklu, piemēram, sojas pupiņu, smalcināšanai.